Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSTA3Q13630 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms