Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PICALMQ13492 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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