Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCIRG1Q13488 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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