Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MSLNQ13421 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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