Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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