Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2BQ13224 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
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