Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NR1H3Q13133 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms