Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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TRAF3Q13114 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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TRAF3Q13114 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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TRAF3Q13114 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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TRAF3Q13114 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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TRAF3Q13114 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF3Q13114 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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