Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHAF1AQ13111 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms