Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX10Q12887 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX10Q12887 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms