Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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