Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BPTFQ12830 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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