Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXO1Q12778 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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FOXO1Q12778 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXO1Q12778 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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