Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RASGEF1BQ0VAM2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms