Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms