Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms