Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDR1Q08345 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDR1Q08345 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms