Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNB2Q08289 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms