Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms