Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCL9Q07325 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms