Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK18Q07002 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms