Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms