Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN12Q05209 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms