Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CD164Q04900 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms