Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX1Q04741 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms