Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBE1Q04446 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBE1Q04446 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms