Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APBA1Q02410 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms