Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms