Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F1Q01094 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms