Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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FAM3AP98173 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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