Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMF1P82094 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TMF1P82094 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TMF1P82094 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMF1P82094 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMF1P82094 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMF1P82094 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMF1P82094 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms