Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRX1P78414 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRX1P78414 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRX1P78414 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms