Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX1P78337 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX1P78337 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX1P78337 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX1P78337 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX1P78337 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms