Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS29P62273 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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