Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UFM1P61960 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms