Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms