Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms