Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms