Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLDN2P57739 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLDN2P57739 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms