Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG3P56975 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG3P56975 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG3P56975 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG3P56975 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms