Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AFDNP55196 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AFDNP55196 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AFDNP55196 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AFDNP55196 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AFDNP55196 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AFDNP55196 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AFDNP55196 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AFDNP55196 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms