Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNA2P51530 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNA2P51530 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNA2P51530 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNA2P51530 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNA2P51530 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNA2P51530 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNA2P51530 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNA2P51530 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNA2P51530 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNA2P51530 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms