Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCAMP50895 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
BCAMP50895 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BCAMP50895 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAMP50895 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAMP50895 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAMP50895 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms