Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK8P49336 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK8P49336 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK8P49336 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK8P49336 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms