Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC1P48995 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms