Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCLMP48507 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCLMP48507 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GCLMP48507 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GCLMP48507 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCLMP48507 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCLMP48507 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms