Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CDKN1BP46527 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms