Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPOP42166 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPOP42166 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPOP42166 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPOP42166 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms