Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC1P41238 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms