Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCAP37840 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNCAP37840 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms